程控全自动厢式隔膜压滤机处理医院废水的工作流程主要分为5个步骤：进料过滤—反吹—隔膜压榨—拉板卸料—水洗。
　　1、进料过滤：医院废水经过初步处理后，通过入料泵进入程控全自动厢式隔膜压滤机，进料压力使滤液穿过滤布，固体被滤布截留形成滤饼。
　　2、反吹：每个完整的工作流程中反吹需进行2次。第1次，污泥进料完成后进行空气反吹，可提高滤饼含固率，同时防止中心管堵塞；第2次，压榨完成后，运行压缩空气系统，对压滤机中心进泥管中的残留污泥及膜腔内的滤液进行反吹洗
　　3、隔膜压榨：关闭进料气动球阀，向隔膜板内注入高压水，最高水压2Mpa，利用隔膜张力对污泥进行强力挤 压脱水，压榨水通过管道回流至压榨水箱，压榨滤液水透过滤布排出，固体物质被滤布阻隔，污泥含固率进一步提高。
　　4、拉板卸料：当压榨完成后，进入卸料工序：脱水后的滤饼自动卸料，将滤饼排出设备。卸饼方式有手动和自动两种，可以根据实际需要进行选择。
　　5、水洗：压滤机在运行一段时间后，滤布会被堵塞，影响过滤效果。程控全自动厢式隔膜压滤机设备自带的高压水洗功能，整个水洗过程全部自动控制。